QCM techniques

[OxyGenS]

Bonsoir !

 

1) https://zupimages.net/viewer.php?id=20/46/nfmm.png

12D vrai : "La méthode à la DGGE et à la RNase sont appropriées à la détection d’une mutation ponctuelle (cf. cours)"

Je vois pas bien à quoi on fait référence ici surtout pour la DGGE.

 

2) https://zupimages.net/viewer.php?id=20/46/5ty3.png

https://zupimages.net/viewer.php?id=20/46/8uig.png

J'avais répondu ABCD pensant que B et C n'étaient pas compatibles avec le fragment présenté dans l'énoncé. Dans la correction on nous indique que la séquence étant impaire, l'enzyme va vraisemblablement couper sans se préoccuper de la base centrale.

Est-ce que c'est tout le temps le cas avec des séquences impaires ou pas ?

 

3) "L’hybridation in situ permet de localiser une région de génome sur une préparation directe des chromosomes en métaphase." --> VRAI. Cela fait référence à quelle partie du cours ?

 

4) Enoncé commun : "À partir d’un exemplaire non marqué d’une sonde (DNA double brin), on cherche à obtenir une sonde marquée résistant aux RNases. Comment peut-on s’y prendre ?"

 

4.1) "On réalise la technique de multi random priming qui consiste à dénaturer la sonde de DNA double brin, à l’hybrider avec des amorces aléatoires (de DNA) et à combler les espaces avec des nucléotides radioactifs et une DNA polymérase, puis dénaturer pour obtenir une sonde ayant la capacité de s’hybrider." --> VRAI.

Pour moi de base on n'a pas de sonde, simplement un DNA double brin qui une fois dénaturé servira de matrice pour synthétiser une sonde marquée.

 

4.2) "Après dénaturation, on peut insérer un brin de la sonde dans un vecteur monocaténaire (phage M13) et répliquer radioactivement le phage à l’exception de la zone où est insérée la sonde afin d’obtenir un ADN simple brin au niveau de la sonde (permettant l’hybridation) et double brin marqué tout autour." --> VRAI.

Je ne comprends pas bien cette façon de faire, pq ne laisser que la sonde monocaténaire (et ne pas la répliquer en même tps) ?

Si tout le reste (radioactif) est double brin dans tous les cas il va falloir les séparer pour qu'un brin s'hybride sur un autre et joue son rôle de sonde radiomarquée non ?

 

Merci

[Liliputienne]

Hello @OxyGenS  

 

1) La méthode DGGE correspond en réalité à l'électrophorèse sur gel en gradient dénaturant (mais c'est curieux de le formuler comme ça puisque ce terme ne ressort pas tel quel dans le cours) c'est donc tout simplement une manière d'isoler les séquences du DNA en utilisant les caractéristiques de dénaturation via l'agent dénaturant 

 

2) Viens regarder ce sujet, ça devrait t'éclairer  https://forum.tutoweb.org/topic/53576-qcm-techniques/?tab=comments#comment-285159

 

 

3) Alors je ne sais pas d'où vient ce QCM, mais il devrait être en BioCel... Mais il est vrai bien vrai que l'hybridation in situ permet de localiser une région de génome sur une préparation directe des chromosomes. EN effet c'est une des techniques de base que l'on utilise dans le marquage. Le principe ici est d'employer une sonde radioactive (avec le marquage au H3, au C14 que tu peux retrouver fréquemment dans les QCM) ; si cette sonde s'hybride spécifiquement avec le DNA ou RNAm que tu cherches à détecter  tu auras un signal radioactif. 

 

4.1) L'énoncé ici fonctionne parce qu'on te dit que la sonde que l'on utilise à la base est double brin. Donc tu pars de ce principe, c'est l'énoncé qui te le dit 

 

4.2) Cette technique est assez incongrue. Déjà petit point info sur le phage M13 (parce que j'ignorais son existence donc j'ai cherché un peu sur l'internet et en fait c'est un virus qui possède des plasmides et ces derniers servent à la recombinaison du DNA de la cellule hôte sans la détruire). 

 

Ici il semblerait que l'on veuille obtenir un sonde de DNA bicaténaire (cf énoncé) c'est pour cela qu'on utilise le principe du phage pour synthétiser du DNA de façon radioactive. Mais c'est assez flou, les items sur les sondes sont généralement beaucoup plus clairs dans les annales et nettement moins alambiqués. C'est pas très représentatif 

 

Dac championne ? 

[OxyGenS]

il y a 57 minutes, Emmacarena a dit :

2) Viens regarder ce sujet, ça devrait t'éclairer  https://forum.tutoweb.org/topic/53576-qcm-techniques/?tab=comments#comment-285159

Désolée je comprends tjs pas

Dans l'énoncé on voit que la 4è base sur le brin 3'-5' est un A donc j'ai mis vrai pour le B car on a un T (au lieu d'un A). Cependant, tu sembles dire que la B est bien reconnue par l'enzyme de restriction, j'en déduis qu'on se fiche un peu de la base centrale. Mais dans ce cas-là pq la C serait vrai (donc pas reconnue) étant donné qu'on a seulement une variation de la base centrale, c'est donc le même cas de figure que le B non ?

 

il y a une heure, Emmacarena a dit :

3) Alors je ne sais pas d'où vient ce QCM

Ils viennent tous du poly TAT Génome R19

 

il y a une heure, Emmacarena a dit :

Dac championne ? 

Le reste c'est ok, merci bcp

[Liliputienne]

Il y a 18 heures, OxyGenS a dit :

2) https://zupimages.net/viewer.php?id=20/46/5ty3.png

https://zupimages.net/viewer.php?id=20/46/8uig.png

J'avais répondu ABCD pensant que B et C n'étaient pas compatibles avec le fragment présenté dans l'énoncé. Dans la correction on nous indique que la séquence étant impaire, l'enzyme va vraisemblablement couper sans se préoccuper de la base centrale.

Est-ce que c'est tout le temps le cas avec des séquences impaires ou pas ?

 

Je t'avoue que j'avais jamais prêté attention à cette théorie... @alpanda si tu passes par là, dis-nous ce que t'en penses. Même si j'avoue que ça me parait tordu 

[alpanda]

@OxyGenS @Emmacarena je ne me souviens pas avoir déjà vu cette théorie... En général les QCMs du Pr Levade ne sont pas aussi ambigus et prennent en compte les cas généraux donc ne te préoccupe pas !

Marque le toi sur un post-it et voit sur le long terme ! Voit si ça retombe dans le poly d'entrainement de la fac comme ça tu verras si tu dois prendre en compte cette règle ou non  

[OxyGenS]

Ça marche merci à vous 2 !