doigt de zinc

[emmmmaaa]

Coucou!

Alors j'aurais une petite question à propos du doigt de zinc... En gros, je ne comprends pas comment faire pour trouver si une séquence peut correspondre à une structure particulière (comme au E) 

 

Merci d'avance à la personne qui prendra le temps de m'expliquer et de lever mon incompréhension 

[Nasgol]

Bonjour,

Peux-tu me donner le contexte général du QCM ? Effectivement je vois qu'il s'agit d'une suite de QCM.

[emmmmaaa]

Il y a 2 heures, Nasgol a dit :

Bonjour,

Peux-tu me donner le contexte général du QCM ? Effectivement je vois qu'il s'agit d'une suite de QCM.

Oui bien sur voila le QCM 13 juste avant 

 

[Nasgol]

Est ce que l'on ne mettait pas le tableau des correspondances [AA-Triplet] à votre disposition ?

[audreyfdn]

Le 07/11/2020 à 10:38, maem a dit :

Coucou!

Alors j'aurais une petite question à propos du doigt de zinc... En gros, je ne comprends pas comment faire pour trouver si une séquence peut correspondre à une structure particulière (comme au E) 

 

Merci d'avance à la personne qui prendra le temps de m'expliquer et de lever mon incompréhension 

Coucou @maem

 

Alors tout d'abord, tu peux voir que la structure donnée correspond à un doigt de Zinc qui comprend 2 Histidines et deux cystéines.

 

Il faut que tu regardes si ta séquence en ARN comporte bien deux Histidines et deux cystéines une fois traduite. 

 

Donc pour commencer il faut tout d'abord trouver le cadre de lecture. Dans l'item, on te donne le cadre de lecture car il est précisé que les trois premiers nucléotides UUU te donne une phénylalanine.

Donc tu sais que le cadre de lecture sera UUU / UCA / CAU / AAA / AUC / CAC / GGU / AGA / AAG / UGU / AUU / UGC /CAG / CUA... 3’,. Tu vas couper ta séquence en triplets de cette manière là pour pouvoir ensuite associer chaque codon à un Acide Aminé.

 

Après avoir formé les codons, tu vas traduire ta séquence en ARN à partir du code génétique donné à la fin du sujet de la colle. 

Tu peux voir dans la séquence qu'il y a en effet le troisième codon (CAU) et le sixième codon (CAC) qui codent des histidines, puis le dixième codon (UGU) et le douzième codon (UGC) qui codent des cystéines. 

Pour aller plus vite, tu peux directement aller chercher les codons qui codent les histidines et les cystéines au lieu de t'embêter à traduire toute la séquence. 

 

Une fois traduite, cette séquence donne une chaine d'AA qui contient bien deux histidines puis deux cystéines. Elle pourrait donc correspondre à la structure en doigt de Zinc proposé dans le QCM.

 

Est ce plus clair pour toi ? 

 

 

[emmmmaaa]

Il y a 7 heures, audreyfdn a dit :

Coucou @maem

 

Alors tout d'abord, tu peux voir que la structure donnée correspond à un doigt de Zinc qui comprend 2 Histidines et deux cystéines.

 

Il faut que tu regardes si ta séquence en ARN comporte bien deux Histidines et deux cystéines une fois traduite. 

 

Donc pour commencer il faut tout d'abord trouver le cadre de lecture. Dans l'item, on te donne le cadre de lecture car il est précisé que les trois premiers nucléotides UUU te donne une phénylalanine.

Donc tu sais que le cadre de lecture sera UUU / UCA / CAU / AAA / AUC / CAC / GGU / AGA / AAG / UGU / AUU / UGC /CAG / CUA... 3’,. Tu vas couper ta séquence en triplets de cette manière là pour pouvoir ensuite associer chaque codon à un Acide Aminé.

 

Après avoir formé les codons, tu vas traduire ta séquence en ARN à partir du code génétique donné à la fin du sujet de la colle. 

Tu peux voir dans la séquence qu'il y a en effet le troisième codon (CAU) et le sixième codon (CAC) qui codent des histidines, puis le dixième codon (UGU) et le douzième codon (UGC) qui codent des cystéines. 

Pour aller plus vite, tu peux directement aller chercher les codons qui codent les histidines et les cystéines au lieu de t'embêter à traduire toute la séquence. 

 

Une fois traduite, cette séquence donne une chaine d'AA qui contient bien deux histidines puis deux cystéines. Elle pourrait donc correspondre à la structure en doigt de Zinc proposé dans le QCM.

 

Est ce plus clair pour toi ? 

 

 

Oh merciii là c'est vachement plus clair et c'est surtout "simple" à faire finalement !