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DNP-AA


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Bonjour!

Je suis bloquée au QCM 21 du TD de biochimie…

Voici l'énoncé: " On traite par le 2-4 dinitrofluorobenzène chacun des fragments obtenus après action de la trypsine sur le fragment N-terminal suivant d'une protéine: Met-Tyr-Cys-Lys-Ala-Arg-Arg-Ile-Ser-Glu-Glu-Gly. Après hydrolyse des liaisons peptidiques, quels sont les DNP-AA susceptibles d'être retrouvés?"

Je sais juste que la trypsine coupe après Lys et Arg mais je ne vois pas comment procéder pour la suite...

  • Solution
Posted (edited)

Salut @Athénaïs!

 

En fait ici, tu dois d'abord regarder combien de coupures peut subir le peptide après action de la trypsine. Tu sais que cette dernière coupe après les lysines et arginines. Or, ici tu as une lysine et deux arginines (qui sont dans le peptide et non aux extrémités) donc la trypsine va couper 3 fois. On va obtenir ainsi 3 peptides et 1 aa isolé après clivage :

- Le premier peptide : Met-Tyr-Cys-Lys, où dans ce cas le DNP va dévoiler le résidu N-term, qui ici est Met. Donc on obtiendra une DNP-Met.

- Le deuxième peptide : Ala-Arg, où on va obtenir un DNP-Ala.

- Le troisième, une aa isolé qu'est Arg, on obtiendra donc forcément un DNP-Arg.

- Le quatrième et dernier, Ile-Ser-Glu-Glu-Gly avec l'obtention d'un DNP-Ile.

 

En fait, à chaque fois le DNP (2-4 dinitrofluorobenzène) révèle l'aa en position N-term

C'est plus clair ?😄

Edited by Dragongnon22
  • 1 year later...

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