QCM TD2 de génome

[Ilyatrogène]

Re-Bonjour, 

Je n'ai pas compris l'item C du QCM 3 du TD2 de génome ni la correction ... je vois bien que ce que la prof a écrit en rouge est la répétition inversée de la séquence du promoteur normal mais je comprends pas on cherche l'élément de réponse à quoi ? ni où est-ce qu'on trouve cette séquence inversée ? 

 

Je suis assez perdue... pouvez-vous m'expliquer svp 

https://goopics.net/i/0JbJO

Je viens de voir que ça a un rapport avec cette diapo mais je ne la comprends pas non plus...

https://goopics.net/i/pgpgv

[audales]

re-bonjour également 

 

ici, on cherche l'élément de réponse à un facteur de transcription = une séquence qui se situe dans la région promotrice d'un gène et qui permet la fixation d'un facteur de transcription. C'est un moyen de régulation de la transcription.

 

Dans l'item B, on te donne le bout de séquence précis = le motif qui permet cette fixation.

 

Dans l'item C, on te demande s'il y a une répétition inverse  -> tu prends le motif (qui va donc de 5' en 3') et tu écris le complémentaire et anti parallèle (donc qui va de 3' en 5'). 

S'il y a une répétition inverse, en lisant le brin complémentaire de 5' en 3' tu retrouves la même séquence que sur le brin de départ (ici sur 6 bases) !

Le cours t'indique que ces répétitions inverses sont spécifiques des séquences qui fixent des hormones (notamment des gluco corticoides) -> ici, ton facteur de transcription est donc certainement une hormone.

 

Si la répétition était directe, tu aurais retrouvé les 6 premiers nucléotides sur le même brin et dans le même ordre a la fin du motif 

 

C'est bien illustré ici :

Le 20/10/2020 à 19:56, lisaspirine a dit :

Salut !

Alors en effet Langin passe assez rapidement là-dessus c’est pas méga compréhensible…

En gros tu peux voir ici que cela va dépendre de comment sont agencées les bases : 

 

Répétition directe = on parle de récepteurs hétérodimères

5’-ATGGCnnnnnnATGGC-3’

3’-TACCGnnnnnnTACCG-5’

 

Répétition inversée = on parle de récepteurs homodimères

    --->   

5’-ATGGCnnnnnnGCCAT-3’

3’-TACCGnnnnnnCGGTA-5’

                           <---

Dans le cas des récepteurs aux glucocorticoïdes GR, les répétitions des séquences GRE (les éléments de réponse des GR) sont inversées donc ils sont homodimères.

Voilà, j’espère que c’est plus clair ! Bonne fin de soirée 

 

 

Voila j'espère t'avoir éclairé 

[adrénalice]

Salut, je me posais la même question donc déjà merci :)) Si on nous donne pas la séquence de l'élément de réponse (comme ici dans l'item B) comment on peut savoir à partir d'ou il commence?

 

Et puis les séquences répétitions inversée/directe elle doivent être "collées" ou on peut trouver des bases entre? 

[victoranduran]

Salut ! alors la séquence te serra toujours plus ou moins donné dans les exos et elles peuvent être collés ou séparé par des bases les deux cas existent