amorces RT PCR

[zlt136]

Salut, 

 

je n'ai pas compris comment savoir quelles amorces utiliser pour la RT PCR, par exemple dans ce QCM (c'est la B qui est vraie) :

 

 

Merci par avance 

[SBY]

Salut @zlt136 !

Pour la RT-PCR, on aura une amorce qui s'hybridera avec le brin anti-sens (orienté 3'-5') et qui aura donc la même séquence que celle proposée dans l'énoncé. Généralement, on aura juste des T à la place des U.  Une deuxième s'hybridera avec le brin sens (orienté 5'-3') et aura donc la même séquence que le brin complémentaire au brin proposé dans l'énoncé. C'est assez flou comme explication donc je te mets un schéma qui peut peut-être t'aider. 

Dans ce genre de QCM, le mieux c'est de commencer par écrire le brin complémentaire et ensuite tu n'auras plus qu'à comparer avec ce qui t'est proposé dans les items mais il faut faire attention à l'orientation des brins !

Pour ce QCM, tu vois que la première amorce de l'item B a une séquence identique à celle du fragment de gauche, elle pourra donc s'hybrider avec le brin anti-sens. La deuxième amorce a quant à elle la même séquence que le brin complémentaire du fragment de droite et pourra donc s'hybrider avec le brin sens. 

Pour l'item A, les 2 amorces ont la même séquence que le brin sens ce qui ne peut pas fonctionner puisqu'on cherche à amplifier les 2 brins. En plus, pour la deuxième amorce, il y a un problème au niveau de l'orientation du brin. 

J'espère que c'est plus clair pour toi. 

Bonne journée !

Edited October 22, 2020 by SBY

[zlt136]

Ok merci j'ai compris ! @SBY