CCB 2017 Maraîchers

[KCAT]

hellooo, j'aurais besoin d'une petite explication concernant ce qcm:

QCM 8 : Concernant l'arginine:

B) A pH=13, son radical n'est pas ionisé 

Révélation

B. VRAI : Phi = 10.8 < 13 donc forme A+

C) A pH=2, son radical est ionisé 

Révélation

C. VRAI : Phi = 10.8 > 2 donc forme A.

 

Je comprends pas, si  considère que le pKr de l'arginine correspond au pHi qui est donc de 10,8 alors le pH étant au dessus (13) on devrais pas avoir déjà une forme A- ? Et pourquoi on nous parle d'une forme A ? Je suis un peu perdu

merciii d'avance :))

[calinora]

Salut @KCAT! Alors pour commencer, on va définir le pk_A : c'est la constante de dissociation, elle se traduit par le passage d'une forme protonée à une forme déprotonée. Chez les acides aminés on distingue :

• Le pK_R : c'est le pk_A du radical mais attention tous les acides aminés n'ont pas forcément un pK_R !!!!
• Le pK_C : c'est le pk_A spécifique de la fonction carboxyle.
• Le pK_N : c'est le pk_A spécifique de la fonction amine.

Le pK_C sera forcément inférieur à 7 et le pK_N supérieur à 7. Dans le cas de l'arginine, le pK_R est aussi supérieur à 7, c'est un acide aminé basique +++.

Donc l'arginine va pouvoir prendre 4 formes différentes :

• Si le pH est inférieur au pK_C (et donc au pK_N !!!) et au pK_R : on a une forme A2+, c'est-à-dire que la fonction carboxyle est protonée (COOH donc pas de charge), la fonction amine est protonée (NH3+ donc une charge positive) et le radical est protoné (double liaison NH2+).
• Si pH est supérieur au pK_C mais inférieur au pK_N et au pK_R : on a une forme A+, c'est-à-dire que la fonction carboxyle est déprotonée (COO- donc une charge négative), la fonction amine est protonée (NH3+ donc une charge positive) et le radical est protoné (double liaison NH2+).
• Si le pH est supérieur au pK_C et au pK_N mais inférieur au pK_R : on a une forme Z, c'est-à-dire que la fonction carboxyle est déprotonée (COO- donc une charge négative), la fonction amine est déprotonée (NH2 donc pas de charge) et le radical est protoné (double liaison NH2+). C'est le zwitterion !! Mme. Sixou définit le zwitterion comme une entité moléculaire chargée qui n'a pas de charge nette (un acide aminé est toujours chargé!! Mais ici on a un - et un +). C'est ce que l'on observe au pHi de l'acide aminé.
• Si le pH est supérieur au pK_C, au pK_N et au pK_R : on a une forme A-, c'est-à-dire que la fonction carboxyle est déprotonée (COO- donc une charge négative), la fonction amine est déprotonée (NH2 donc pas de charge) et le radical est déprotoné (double liaison NH donc pas de charge).

 

Il y a 18 heures, KCAT a dit :

B) A pH=13, son radical n'est pas ionisé 

L'item est vrai mais il me pose problème car il ne me semble pas que l'on doit connaître les pK_R exacts des AA, on doit juste savoir s'ils en ont un ou pas et si oui savoir s'il est basique ou acide. J'ai cherché sur internet et le pK_R de l'arginine est de 12,5 donc on aura une forme A-, le radical est sous sa forme déprotonée et n'est pas ionisé (le problème c'est que si le pK_R était supérieur à 13 (bon ça paraît un peu haut certes) on aurait eu une forme Z)

 

Il y a 18 heures, KCAT a dit :

C) A pH=2, son radical est ionisé 

L'item est vrai, le pK_R du radical est supérieur à 7 donc on est laaaaaaaargement au-dessus de 2 ! Le radical aura une forme protonée donc chargée - !

 

 

Voilà, moi j'aurais résolu le QCM comme ça, même si j'aurais eu un doute sur l'item B 

En espérant t'avoir aidé un petit peu !

[KCAT]

Coucou @calinora ! Alors déjà merci beaucoup pour ton message super détaillé !!  Et par rapport aux items B et C du coup on m'a expliqué en fait qu'il fallait juste comparer le pKr avec le pH, et pour l'arginine il est de 10,8 (je crois qu'il faut les connaître mais je veux pas te dire de bêtises  ), du coup avec un pH de 13:

pH > pKr, on a une forme déprotonée (du radical) et la forme déprotoné est non ionisé --> donc c'est vrai

Pour l'item C pareil

pH < pKr et donc forme protoné c'est à dire la forme ionisé !

Voilà c'est peut être pour ca que l'item B te posait problème,  j'espère que je t'embrouille pas plus et que je te dis pas n'importe quoi surtout ! En tout cas merci de ton explication