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hybridation sonde et mutation silencieuse


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Posted (edited)

chalut 

 

petit interrogation j'ai pas de QCM sous la main mais je me demandais, on prend un patient M et on prend un patient N, est ce que si y'a une mutation genre une petite silencieuse qui passe crême chez N, en plein milieu d'un EXON, vraiment une seul pas de frame shift par déletion, ni de codon stop: juste de la variabilité non pathogène, et qu'on fait une RT PCR, puis pour révéler on envoie une sonde qui reconnaissait l'exon de M non muté sur N muté, est ce qu'elle s'hybride ? 

 

est ce qu'il existe des cas dans les exo de levade où y'a ce genre de réflexion ? 

 

 

 

merci bcp  ++++ ^14 

Edited by SJr
  • Solution
Posted (edited)

Il me semble qu'elle s'hybride oui, une pcr mettant en évidence que des grosses mutations 😉

Edited by maestro
  • Ancien Responsable Matière
Posted

Ça dépend de la taille de la sonde il me semble. Si elle est grande oui (elle se fixera peut-être un peu moins bien, mais elle se fixera quand même). Mais si t'as une petite sonde de 5 bases là elle ne se fixera pas. La sonde elle s'en fout que ce soit un intron ou un exon, et que le mutation soit silencieuse ou non. Elle a une séquence nucléotidique et elle s'apparie au complémentaire, ou à quelque chose qui y ressemble vraiment beaucoup.

Posted

Dans l'exemple de @SJr, je pense qu'il veut savoir si on peut detecter une mutation ponctuelle avec une sonde,

 

Pour mettre en évidence une mutation d'une base tu ne peux utiliser une sonde,

 

La sonde peut s'hybrider chez le patient comme chez le malade--> il peut être quand même malade ( faux négatif), et il peut etre sain/avoir vrnmnt la même séquence ( négatif vrai) 

 

Mais, la sonde peut ne pas s'hybrider, mais tu ne pourras conclure que le patient est " necessairement" ( levade utilise bcp ce terme) malade, puisque cela peut être un résultat positif faux ( il est malade mais la sonde ne s'hybride pas pour X ou Y raisons),

 

bref, bon courage à vous

Posted

merci de vos réponses 

 

ok donc si c'est pas trop une grosse mutation ça passe, je voulais être sûr on sait jamais 

 

 

yes bon courage .. c'est bientôt ! 

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