items en vrac génome

[Jou222]

Bonjour a tous, j'ai quelques questions de génome en cette douce soirée:

Tout d'abord je ne comprends pas bien pourquoi l'item 8D du CCB 2017 est compté fausse. J'applique toujours la même méthode et je trouve pour les autres items mais celui ci je vois pas...

https://www.noelshack.com/2019-42-6-1571515775-capture-d-ecran-2019-10-19-a-22-09-05.png

 

Dans le même style je vois pas non plus pourquoi la 12 D eu CC2018 est fausse:

https://www.noelshack.com/2019-42-6-1571516126-capture-d-ecran-2019-10-19-a-22-15-22.png

https://www.noelshack.com/2019-42-6-1571516254-capture-d-ecran-2019-10-19-a-22-17-29.png

 

Edit: autre petite question:

comment on sait pour la 5E que seulement deux fragments suffisent ? Il faut bien les 3 produits de départ pour obtenir la séquence entière de la 3ème étape non?

édit: ouuuups bon lien : https://www.noelshack.com/2019-42-7-1571558428-capture-d-ecran-2019-10-20-a-10-00-15.png

 

Voila voila ! 

Merci d'avance

Edited October 20, 2019 by Jou222

[SeverusRogue]

Salut @Jou222,

 

pour le CC2018 t'as une correction détaillée sur la librairie.

 

Pour ta première question je vois pas non plus.

 

Et pour la dernière je crois que c'est pas le bon screen

[Meliodas]

Salut, la 8D est fausse car les enzymes de restriction utilisées sont HindIII (en première position), et BAMHI (en dernière), il faut donc imaginer que tout ce qu'il y a entre ces deux enzymes est éliminé.

Or, on te demande une situation où le fragment à insérer (donc entre HindIII et BamHI) est à cliver, ce qui n'est pas le cas ici, car tu peux voir que la séquence de BtsCI (et par ailleurs toutes les autres séquences des autres enzymes de restriction) est éliminée et donc il n'y aura pas de clivage dans le fragment inséré, sachant qu'il n'y a pas d'autre séquence reconnue par FokI (commune à BtsCI).

 

J'espère avoir été clair ^^

Révélation

 

En gros, dis toi que A, et E sont HindIII et BamHI, tu vois qu'il y a plus d'enzyme de restriction pour couper ce qui s'insère entre les 2  

Edited October 20, 2019 by Meliodas

[SeverusRogue]

@Meliodas

mais du coup c'est quoi la différence avec celui-ci ? (item D aussi, mais là c'est VRAI) https://www.noelshack.com/2019-42-7-1571557793-dsc-0240.jpg

[Meliodas]

Dans celui-ci, on te dit qu'il y a une séquence GGATG d'emblée, juste avant ta séquence de 4 sites de restrictions, ça change donc la donne car dans le qcm montré par @Jou222, le site GGATG est apporté par BtsCI seulement !

[SeverusRogue]

@Meliodas ah oui d'accord merci, c'est le schéma dans l'énoncé qui m'a induit en erreur

[Meliodas]

Pas de soucis, dans tous les cas en génome faut vraiment faire attention à tous les détails dans l'énoncé car il suffit d'une phrase ou d'un mot pour tout changer

[Jou222]

il y a 8 minutes, Meliodas a dit :

Dans celui-ci, on te dit qu'il y a une séquence GGATG d'emblée, juste avant ta séquence de 4 sites de restrictions, ça change donc la donne car dans le qcm montré par @Jou222, le site GGATG est apporté par BtsCI seulement !

Okok je vois, j'avais le même pb que @SeverusRogue ! Merci beaucoup @Meliodas !

Et pour la 5E (avec le bon lien cette fois) ? 

 

[SeverusRogue]

Pour la 5E, comme t'as qu'un seul fragment d'ADN à l'étape 2, pour l'amplifier (étape 3), t'as juste besoin de 2 amorces, une à chaque extrémité.

[Jou222]

Ah oui ok je pensais que oligodesoxynucléotide était équivalent à fragments dans cet item alors qu'on parle des amorces!

Merci @SeverusRogue