Réparation

[yeehaw]

salut ! j'ai quelques questions concernant ce QCM 

déjà, je ne comprends pas pourquoi, chez les cellules quiescentes, l'irradiation aux UV a pour conséquences qu'il y ait autant d’incorporation de thymine.. on voit que pour le sujet normal 1, par exemple, le taux de thymine incorporée sans UV est de 260 et lorsqu'on les irradie, le taux monte jusqu'à 8000. Je sais que les UV causent des dimères de thymines mais je pensais que c'était avec les T qui étaient déjà présentes (jsp si c'est clair mais en gros je ne pensais pas que les UV augmentaient le taux de thymines... et je ne comprends pas pourquoi c'est le cas).

de plus, je ne comprends pas pourquoi l'item C est juste. Selon ce que j'ai compris, la réparation des dimères de thymines ne consiste pas à rajouter des thymines mais juste à les séparer. donc pourquoi la réparation augmente le taux de thymines? 

Je sais que ce n'est pas très clair mais bon, j'espère que quelqu'un arrivera à me comprendre 

[Paracétamal]

bonsoir cher ami où as-tu trouvé ce QCM que je puisse t'apporter un maximum d'éclaircissements possibles

[yeehaw]

@ParacétamalDu poly du tat 

Edited September 27, 2019 by ms987

[Cristal-STAL]

saluut @ms987 ! 

 

il y a 8 minutes, ms987 a dit :

@ParacétamalDu poly du tat 

 Peux tu être plus précis sur la source du QCM, car malheureusement je ne retrouve pas exactement le même tableau que toi (énoncé et donné modifié dans le poly 2019-2020) et c'est surtout pour vérifier que tes questions ne viennent pas d'un potentiel errata fait à cette époque  

[Paracétamal]

bonsoir @ms987

je vais répondre à la première partie de ta question : il s'avère que les UV provoquent, en plus des dimères de pyrimidines, des cassures simples ou doubles brins (et ce ne sont les pas seuls effets sur la structure du brin d'ADN et de ses bases, on a par exemple la dépyrimidation/dépurination = une base est excisée) ainsi si on a une réparation non homologue ou même homologue le fait que le milieu soit enrichi en T tritiée va permettre d'en incorporer dans ton/tes brins d'ADN de manière significative

 

concernant l'item C j'aurais besoin aussi de plus de précision sur le QCM notamment l'année, le poly...

 

j'espère avoir répondu au moins à la première partie de ta question n'hésite pas si ça reste flou et puis la team Génome sera présente à la perm de Lundi midi si jamais

 

bonne soirée et bon we

Edited September 27, 2019 by Paracétamal

[yeehaw]

Il y a 2 heures, Cristal-STAL a dit :

saluut @ms987 ! 

 

 Peux tu être plus précis sur la source du QCM, car malheureusement je ne retrouve pas exactement le même tableau que toi (énoncé et donné modifié dans le poly 2019-2020) et c'est surtout pour vérifier que tes questions ne viennent pas d'un potentiel errata fait à cette époque  

 

Alors précisément, il vient du poly Genome Maraîchers 2019-2020. C’est le chapitre « STRUCTURE MOLÉCULAIRE DE L’ADN - RÉPLICATION - RÉPARATION. », c’est le QCM 29 tiré de la série 2 des QCM

il y a 40 minutes, Paracétamal a dit :

bonsoir @ms987

je vais répondre à la première partie de ta question : il s'avère que les UV provoquent, en plus des dimères de pyrimidines, des cassures simples ou doubles brins (et ce ne sont les pas seuls effets sur la structure du brin d'ADN et de ses bases, on a par exemple la dépyrimidation/dépurination = une base est excisée) ainsi si on a une réparation non homologue ou même homologue le fait que le milieu soit enrichi en T tritiée va permettre d'en incorporer dans ton/tes brins d'ADN de manière significative

 

concernant l'item C j'aurais besoin aussi de plus de précision sur le QCM notamment l'année, le poly...

 

j'espère avoir répondu au moins à la première partie de ta question n'hésite pas si ça reste flou et puis la team Génome sera présente à la perm de Lundi midi si jamais

 

bonne soirée et bon we

Merci beaucoup pour l’aide !

Et pour ma 2ème question, j’ai mis la référence de l’item plus haut

[Cristal-STAL]

hey salut mon pote @ms987, désolé pour ce petit problème qu'on a eu à te répondre donc je vais essayer de faire ça bien

 

Alors pour réparer ton ADN il y a énormément de mécanismes (car c'est quand même l'une des choses la plus importante de notre organismes),  mais nous on va se concentrer sur les dimères de thymines.

 

Il existe donc 2 mécanismes pour les dimères de thymines : 

 

• Réparation direct ou réversion des anomalies : donc ce mécanisme tu l'as compris, c'est celui dont tu parles, une enzyme appelée la photolyase va repérer les dimères de thymines et les répare directement, sans rajouter de la T ou autre juste elle va "enlever" le pont qui est formé entre les 2 Thymines. 

mais attention il existe un autre mécanisme qui va changer complètement la vision du QCM  

•  Le système NER : système par excision de nucléotides :  ce système est spécialisé dans la réparation des dimères de thymines . Le brin portant le dimère est excisé (coupé) sur une distance de plusieurs dizaines de nucléotides (29 pour être précis mais absolument pas à apprendre) puis ensuite il y aura action d'une ADN polymérase pour combler la lacune (donc c'est là qu'on va rajouter les T tritiées du QCM ) et attention les petits pièges : après tout ce remue ménage il y a action de la ligase (pour "relier" le nouveau brin synthétisé à celui qui existé déjà) MAIS AUSSI des topoisomérases (pour éviter les super tour de ton ADN) 

voila @ms987 normalement avec ces infos en plus tu devrais comprendre , si c'est pas encore assez clair n'hésite pas et viens même à la perm de lundi @Paracétamal et moi-même t'accueillerons comme il se doit. 

 

bon week end et bon courage 

[yeehaw]

@Cristal-STAL merci beaucoup pour l'explication, ça m'a bien aidé! Juste... tu as précisé que les topoisomérases interviennent dans le mécanisme de réparation NER mais il me semble que Bettina a seulement précisé que les topoisomérases agissent pour le mécanisme MMR... Du coup, dans quels mécanismes les topoisomérases agissent-elles? Je peux toujours venir à la perm pour poser la question  :) 

[Cristal-STAL]

Avec plaisir @ms987

 

il y a 10 minutes, ms987 a dit :

Du coup, dans quels mécanismes les topoisomérases agissent-elles?

Les topoisomérases agissent pour BER, NER et MMR. En faite dans ces 3 systèmes on va "couper" sur plusieurs nucléotides quand il y a un problème et on va par la suite "boucher" le trou qu'on a fait avec une polymérase comme dans la réplication, donc on a besoin de topoisomérases pour éviter les super tour de l'ADN.  (bien sur dans mon message j'ai réduit les mécanismes NER BER et MMR à juste "couper" "boucher" mais pour le concours vous avez à apprendre ce qui se passe avec bcp plus de détails, ici c'était juste pour expliquer la présence des TOPOISOMERASE) 

 

[yeehaw]

il y a 5 minutes, Cristal-STAL a dit :

Avec plaisir @ms987

 

Les topoisomérases agissent pour BER, NER et MMR. En faite dans ces 3 systèmes on va "couper" sur plusieurs nucléotides quand il y a un problème et on va par la suite "boucher" le trou qu'on a fait avec une polymérase comme dans la réplication, donc on a besoin de topoisomérases pour éviter les super tour de l'ADN. (bien sur dans mon message j'ai réduit les mécanismes NER BER et MMR à juste "couper" "boucher" mais pour le concours vous avez à apprendre ce qui se passe avec bcp plus de détails, ici c'était juste pour expliquer la présence des TOPOISOMERASE) 

 

 

d'accord parfait merci !!