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ERRATA Colle n°4 15.10.2018 - BIOMOLECULES


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  • Ancien du Bureau
Posted

Saluuut ! :rangs:

 

Vous pouvez débattre ici des potentiels errata de la colle concernant la partie BIOMOLECULES!

 

 

Merci pour votre bonne humeur, à la semaine prochaine ❤️?

  • Ancien du Bureau
Posted

Bonjour, 

 

11A. Comptée vraie. Je ne comprends pas puisque Q est impliqué dans le transport d'ammoniac NH3. Est ce que fonction amine et ammoniac sont les mêmes choses ? 

 

Merci beaucoup pour la colle ?

Posted

Bonjour ? En fait l'ammoniac c'est le NH3. Mais cette année, le prof a changé NH3 par NH2. Du coup, il faut retenir que:

L'acide glutamique E fixe la fonction amine (NH2) des acides aminés pour éviter la formation d'ammoniac. Quand il l'a fixé, il se transforme en glutamine Q  qui lui a un rôle dans le transport et stockage de NH2. 

Donc, ammoniac et fonction amine ne sont pas les mêmes choses

Posted

Bonsoir et merci pour la colle ? 

J'ai deux petites questions :

- qcm 3 item E : je n'ai aucune idée de ce qu'est le N-methy-N-guanidoacetate, dans quelles réactions intervient-il ? 

- qcm 7 item A : je ne comprend pas pourquoi on parle de monomères alors qu'il me semble qu'il y a 4 sous unités différentes (2 chaînes lourdes et 2 chaînes légères) : ce ne seraient pas du coup plutôt des heterotetrameres ? 

 

Merci ! 

Posted

Bonsoir @dupuyadèle !

 

QCM3 item E : le N-méthyl-N-guanidoacétate est le nom chimique de la créatine ! ça a du être précisé à l'oral par le Pr Perret en cours ?

 

QCM 7 item A : attention à ne pas confondre tétramère et tétracaténaire, c'est un piège qui tombe souvent (surtout quand vous aurez vu les chromato par gel filtration tu verras !)

Une protéine multimère est une protéine composée de plusieurs sous-unités (structure quaternaire) reliées entre elles par des liaisons faibles seulement !! (comme les trois hélices qui composent le collagène par exemple --> cela forme un trimère)

Une protéine multicaténaire est une protéine composée de plusieurs chaînes (structure tertiaire) reliées entre elles par des ponts disulfures !! (comme les 4 chaînes qui composent une immunoglobuline --> c'est donc un monomère [tous les peptides qui le composent sont reliés entre eux par des ponts disulfures] tétracaténaire [il comporte 4 chaînes reliées entre elles par des ponts disulfures])

Dans d'autres matières il y aura des raccourcis qui seront faits (ex : la double hélice d'ADN qu'on appelle bicaténaire alors que les deux brins sont reliés par des liaisons faibles --> en biomol on devrait l'appeler dimère) mais les profs de biomol sont très pointilleux sur cette distinction!

Pour aller plus loin : le SDS sépare seulement les sous-unités reliées par des liaisons faibles donc ne séparera pas un monomère tétracaténaire, par contre le beta-mercaptoéthanol qui casse les ponts disulfures séparera les 4 brins de ce tétracaténaire.

 

En espérant avoir répondu à tes interrogations.

Posted

Bonjour !

En refaisant la colle de lundi je n'arrive toujours pas à comprendre comment on trouve la position de F et de C dans la chaîne peptidique ?

En espérant que quelqu'un pourra me répondre !

Posted

Bonjour !

1. On te dit que la chymotrypsine est sans effet avec ou sans prétraitement par le bêta mercaptoéthanol, or la chymotrypsine coupant après les AA aromatiques, F est forcément à la fin du peptide (et la chymotrypsine coupe dans le vide).

2. De plus, tu sais qu'après clivage de pep par la trypsine, les peptides I et II sont reliés par un pont disulfure (car sans prétraitement au beta mercaptoéthanol il migre a 880 et avec beta mercaptoéthanol il migre a 330+550). Il faut donc une cystéine dans chacun des deux peptides (pour qu'ils puissent être reliés pas un pont disulfure). Or tu sais que le peptide I finit par F et commence par T (suite au DNFB). La seule place possible pour C dans le peptide I est donc entre T et F.

Idem pour le peptide II, tu sais qu'il a 5 AA (car il pèse 550 Da), qu'il commence par M, Q, T (réaction du PITC) et qu'il finit forcément par R parce que la trypsine coupe après lui. La seule place possible pour la Cys est donc en 4ème position.

J'espère que c'était clair ?

Posted

Salut @HereWeGO ! Alors oui ton explication est très claire merci d'avoir pris le temps ? 

Il reste un point que je ne comprends pas, si on dit que le peptide pep est insensible à l'action de la chimotrypsine comment peut-elle couper quand même ?

Posted

Non au final elle ne coupe pas ! J'ai dit "coupe dans le vide" pour que tu comprennes mais elle ne coupe juste pas vu qu'elle n'a rien a couper après F

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