CCB 2012 QUESTION 4

[Sarrabm]

Bonjour !! Alors voila dans l'énoncé on donne les infos suivantes concernant le peptide "pep" :

 

- traitement au SDS-PAGE : une bande de MM 1540 Da

- Après action du BMercato : Une seule bande de 770 Da 

-composition en AA pour chaque bande de 770Da : C E F N R S T

-traitement par le DNFB ==> DNP-Thr

-traitement par la trypsine donne 2 peptides : peptide I (MM=330Da) et peptide II (MM:880) 

-traitement du peptide I par DNFB ==> DNP-Thr 

-traitement peptide II par DNFB ==> DNP-Ser

-Phi peptide 1 = 6.8

- la chymotrypsine est sans effet sur "pep"

 

 

 

En fait je voudrais juste savoir si je visualise bien la structure du peptide : 

 on a un homodimère, et sa strucure est du type T_R S _ _ C C _ _ R _ _ F

Mais dans ce cas je ne comprends pas pourquoi on n'obtient q'un seul petite de 330 Da et pas 2 

 

Merci d'avance !!!

[Drizer47]

Salut ! 

Alors pour la structure du peptide tu n'es pas loin c'est :  T E R S N/C N/C F

                                                                              T E R S N/C N/C F

Tu as bien raison c'est un homodimère.

Après traitement à la trypsine on obtient 2 peptides : 330 Da et 880 Da

C'est ce que l'on voit au niveau des bandes du SDS-PAGE. Cependant si il existe 2 peptides de même masses moléculaires ils se superposent sur le SDS-PAGE et donc tu ne verras qu'une bande. 

En fait ici tu as 2 peptides de 330 Da et 1 de 880 Da (là où se situe le pont disulfure). Si tu fais la somme tu retrouves bien 1540 Da du départ.

 

Pour le peptide 1 tu n'avais pas trouvé l'acide glutamique. Cela se fait avec l'information du pHi.

Tu vois qu'il est de 6,8 et tu sais qu'on a T et R. T étant plutôt neutre et R basique il te faut un AA acide pour équilibrer le pHi vers la neutralité donc E. 

Si tu fais la calcul du pHi avec TER tu retrouves 6,8.

[Sarrabm]

Super !! Merci beaucoup !!! Bonne journée !