gnocchi Posted January 28 Posted January 28 Bonjour, Il y a un détail qui me chiffonne un peu :) En fait dans le séquençage la lecture se fait dans le sens 5' 3' ce qui veut dire que la synthèse se fait dans le sens 3' 5' ce qui veut dire que quand on fait une électrophorèse, les fragments les plus petits sont plutôt du côté 3' ce qui veut dire que c'est eux qui vont migrer le plus loin et donc par conséquent quand on lit une plaque du bas vers le haut on lit la séquence dans le sens 3' 5' or pourtant c'est l'inverse. Si quelqu'un pouvait éclairer ma lanterne svp Quote
Tuteur Solution mate_ces_teh Posted January 28 Tuteur Solution Posted January 28 Salut ! Alors attention niveau formulation, que ce soit pour le séquençage selon Sanger ou un autre contexte, la synthèse d'ADN se fait toujours en 5'->3'. Aussi un conseil ça va être de faire attention au sens de migration de l'électrophorèse car si elle est de bas en haut, les fragments les plus petits se retrouvent "en bas" (c'est le cas dans les diapos de cours), mais si c'est l'inverse ils se retrouvent "en haut". Comme l'élongation se fait bien de 5' vers 3', les fragments les plus petits correspondront à la partie 5' de la matrice, et les plus longs iront jusqu'à la partie 3'. Pour lire dans le bon sens il faut donc bien commencer par les petits fragments. J'éspère que c'est plus clair, hésite pas si besoin ! An-Schwann and Joan_bcs 2 Quote
gnocchi Posted March 17 Author Posted March 17 Salut, pendant mes révisions je suis retombée sur le truc qui m'avait fait buggé. C'était cette diapo https://ibb.co/23JrbTWK Et la prof avait dit que la bonne amorce c'était la n°3, es ce que qqn peut m'expliquer pourquoi svp ? Quote
Ancien Responsable Matière Nentiqu Posted March 17 Ancien Responsable Matière Posted March 17 il y a 55 minutes, gnocchi a dit : Salut, pendant mes révisions je suis retombée sur le truc qui m'avait fait buggé. C'était cette diapo https://ibb.co/23JrbTWK Et la prof avait dit que la bonne amorce c'était la n°3, es ce que qqn peut m'expliquer pourquoi svp ? Coucou, sur cette diapo on voulait séquencer le fragment hachuré, pour ce faire il nous fallait donc l'amorce au plus proche (la 3 ou la 4) et surtout une amorce dans le bon sens, en effet ton élongation va se faire de 5' vers 3', l'amorce 4 est donc mauvaise car (si on imagine que nos amorces sont des flèches pointant de 5' vers 3', ce qui est souvent le cas dans les annales) elle pointe à l'opposé de notre séquence d'intérêt. Est-ce que c'est plus clair pour toi? Bon courage An-Schwann 1 Quote
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