Phi

[mann.009]

Bonjour,

je me demandais comment on était censés calculer un Phi lorsqu’on a des peptides très longs (dans un exo du prof il y en a 11…). 

On est censé utiliser ces formules ? car en td le professeur les dessinait mais pour faire ça la ça m’a l’air un peu long.

 

MERCII

Edited Wednesday at 10:43 AM by mann.009

[Rayanodipine]

Coucou @mann.009 !

Peux-tu me me montrer l’exo où vous êtes censés calculer le pHi d’un peptide de 11 acides aminés ? Il y a sûrement un autre moyen pour le faire dans l’exo en question.. ou sinon tous les acides aminés sont neutres..

À l’examen, vous aurez grand max 4 fonctions ionisables, parce qu’effectivement, ça prend beaucoup de temps.

[mann.009]

C’est lui mais si j’ai bien compris on prend en compte que le N terminal C terminal et les radicaux ionisable ? 

 

On considère le peptide suivant : Met-Lys-Ile-Phe-Ser-Val-Tyr-Ile-Leu-Glu-Gly, quelles sont es propositions exactes?

1. La masse moléculaire du peptide avoisine 11 200 Da
2. Ce peptide peut être la partie N-terminale d'une protéine traduite
3. Le traitement du peptide par la trypsine génère 2 peptides
4. Le traitement du peptide par la chymotrypsine génère 2 peptides
5. Le pHi de ce peptide est voisin de 6,65.

NB : On rappelle les valeurs approchées des pK des différents groupes ionisés : a-aminé : 9,3 ;

a-carboxylique : 2,1 ; ¿-aminé: 10,5 ; y-carboxylique : 4.

[Rayanodipine]

18 minutes ago, mann.009 said:

C’est lui mais si j’ai bien compris on prend en compte que le N terminal C terminal et les radicaux ionisable ? 

C’est ça ! 
Ton peptide de 11 acides aminés ne comporte finalement que 4 fonctions ionisables ! 

Fonction alpha-amine de la méthionine. 

fonction alpha-carboxylique de la glycine.

fonction epsilon-amine de la lysine.

fonction gamma-carboxylique de l’acide glutamique.

 

Par conséquent, tu peux schématiser ton peptide comme ça : https://ibb.co/xqdv9GGp

Et là tu dessines, comme vous avez fait en TD, pour calculer ton pHi. 

 

J’espère avoir été clair !