PCR

[inositol]

Bonjour,

j’ai une question concernant la PCR, est ce que si les amorces s’hybrident dans ce sens ca marche ? 

 

 

merci !

[Androma]

Salut !

Les amorces ne peuvent pas s'hybrides dans ce sens-là car l'ADN est anti-complémentaire. Or ici l'amorce est dans le même sens que l'ADN. La flèche doit être dans l'autre sens pour que ça fonctionne. 

 

Pour rappelle, l'ADN est anti-complementaire, ça veut dire que le côté 5' d'un brin doit être en face du côté 3' de l'autre brin :

5' ATGTAG------------------TGAAC 3'

3' TACATC------------------ACTTG 5'

C'est vrai même si l'autre brin est de l'ARN :

5' ATGTAG------------------TGAAC 3'

3' UACAUC------------------ACUUG 5'

Et pour les amorces, les flèches sont aussi dans le sens 5' ----> 3'

 

N'hésite pas si tu as des questions, bon courage !

[elec]

Salut @inositol ! 

 

Alors non si les amorces s'hybrident tel que tu le montres, la PCR ne marchera pas !

 

Explications : la PCR sert à amplifier des séquences d'ADN. On utilise pour ça une polymérase (en l'occurence la Taq) qui a la capacité de synthétiser des nouveaux brins, à partir de brins déjà présents et ce, en présence d'amorce. Or, les polymérases ne fonctionnent que dans le sens 5' -> 3' à partir de l'amorce. Donc, si on reprend ton schéma, tu as mis les amorces à la fin du brin, donc la polymérase qui va venir essayer de synthétiser un nouveau brin d'ADN va pas aller très loin puisque c'est déjà la fin du brin... Et ducoup, tout ce qu'il y a avant l'amorce ne sera jamais lu (donc jamais synthétisé donc jamais amplifié) par la polymérase puisqu'elle n'est pas capable de lire dans le sens 3' -> 5' ! Et DONC la PCR ne marchera pas...

 

J'espère que tu m'as suivie, c'est pas forcément évident donc n'hésite pas si tu as d'autres questions et bon courage !

[inositol]

ok super ! merci beaucoup à vous 2 !!