leo907853 Posted November 3, 2016 Posted November 3, 2016 bonjour es ce que c possible de m'aider a résoudre la question 1 de génome du concours de 2010? MERCI D'AVANCE
Solution SweetPM Posted November 3, 2016 Solution Posted November 3, 2016 Bonsoir Pour commencer, un rappel qui paraît trivial mais qui a son importance dans cet exercice : l'ADN génomique contient tous les introns et les tous les exons tandis que les ARNm ne contiennent que des exons (et pas forcément tous #épissage). A. Faux : Sur le gel correspondant au foie, on voit que la piste 1 ne comporte pas de bande. C'est parce que la PCR n'a pas pu se faire parce que l'amorce sens de l'extrémité 5' de l'exon 1 ne s'est pas hybridée. On sait que c'est l'exon 1 qui est absent et pas l'exon 4 car sinon on n'aurait aucune bande sur le gel étant donné que toutes les amorces anti-sens des couples 1, 2 et 3 s'hybrident sur l'exon 4. Attention, en ce qui concerne le gel de l'ADN génomique, on n'a pas non plus de bande avec le couple 1 d'amorces mais ce n'est pas pour la même raison car l'ADN génomique, par définition, contient tous les introns et tous les exons ! Il est précisé dans l'énoncé que la Taq polymérase, dans ces conditions, n'amplifie pas des régions de plus de 10kpb, or si tu regardes l'échelle, exon 1 + intron 1 + exon 2 font plus que ça donc l'absence de bande est simplement due à la présence de l'intron qui rend la zone trop longue pour la PCR. B. Vrai : Comme dit précédemment, on voit des bandes sur les gels de ces deux ARNm, or on sait que pour chaque couple, une des amorces est localisée sur l'exon 4 donc il est présent, sinon la PCR n'aurait pas fonctionné. C. Vrai : Sur le gel d'agarose d'ARNm de foie, on voit deux bandes au niveau du couple d'amorces n°2 dont l'amorce sens est localisée sur l'exon 2; celui-ci est donc présent. D. Vrai : toujours sur la piste 2 d'ARNm de foie, on voit apparaître 2 bandes à 240 et 360 pb et si on fait la différence... magie magie, on tombe sur 120 pb, soit la taille qu'on nous donne pour l'exon 3 dans l'énoncé ! Comme les amorces sont localisées sur l'exon 2 et l'exon 4, il n'y a que 2 possibilités d'épissage : soit on a les 3 exons (2-3-4), soit on n'a que 2 et 4. Ainsi dans le foie, on a 2 ARNm différents issus de l'épissage alternatif de l'exon 3. E. Vrai : L'intron 3 se situe entre l'exon 3 et l'exon 4. Grâce à la piste 3 du gel des ARNm de foie, on sait que exon 3 + exon 4 = 140 pb car les amorces sont en 5' des exons donc on a leur pleine longueur. Sur le gel de l'ADN génomique, la piste 3 nous apprend que exon 3 + intron 3 + exon 4 = 4750 pb. Ainsi, pour connaître la longueur de l'intron 3, il suffit de faire 4750 - 140 = 4610 pb Voilà, j'espère que ça t'éclairera et n'hésite pas à redessiner au brouillon l'ADN génomique et les ARNm en plaçant les amorces pour mieux visualiser les choses
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