adn double brin

[Celia_que]

bonsoir,

est-ce que quelqu'un pourrait m'éclairer sur comment interpréter un adn circulaire ?

je m'explique : en gros sur un adn double brin linéaire, on sait qu'on a un brin 5'3' et l'autre 3'5', donc par ex si on a un schéma avec une amorce positionnée au dessus du brin sens, on sait qu'elle s'hybride avec lui et que donc elle est "orientée" 3'5' (mm si elle synthétise de 5' vers 3').

Or pour un adn double brin circulaire du coup il n'y a pas d'orientation ? fin aucun n'est ni 5'3' ni 3'5' si ? dans ce cas l'amorce 3 par ex (pièce jointe) ne peut pas être "fausse" (contrairement à un brin linéaire ou on peut nous proposer des amorces qui sont dans le même sens que le brin donc ça marche pas comme les exos PCR du S1) et, c'est juste que selon si on prend la 3 ou la 4 l'amorce synthétise vers un sens ou l'autre ?

Dans ce cas est-ce qu'on doit considère que si l'amorce est au dessus du double brin (ex amorce 3), elle s'hybride forcément avec le brin le plus extérieur ? parce que sinon on ne peut pas savoir du coup si elle va s'hybrider avec celui extérieur ou intérieur et donc si elle va synthétiser un fragment correspondant au brin ext ou int ?

de même j'ai employé extérieur ou intérieur car je ne sais pas lequel correspondant au brin sens/ non sens, est-ce qu'on peut le déterminer ici ?

 

si quelqu'un peut m'éclairer

et si besoin je peux reformuler n'hésitez pas à me le demander

 

purée je n'arrive pas à insérer la pièce jointe ça me met que le fichier est trop lourd, mais si jamais je parle de la diapo 56 du cours de mm Couderc

[Enzocytocine]

Bonsoir !

Est-ce que tu pourrais envoyer une capture d'écran de ce qui te pose problème ? J'ai regardé le cours de Mme Couderc et diapo 56 il n'y a pas d'ADN circulaire

[alicetone]

coucou @Celia_que ton message n'était pas dans la bonne section :)

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@dzinthesky @Fodiliaque 

 

[mathi.asparagine]

  On 1/17/2025 at 5:59 PM, Celia_que said:

bonsoir,

est-ce que quelqu'un pourrait m'éclairer sur comment interpréter un adn circulaire ?

je m'explique : en gros sur un adn double brin linéaire, on sait qu'on a un brin 5'3' et l'autre 3'5', donc par ex si on a un schéma avec une amorce positionnée au dessus du brin sens, on sait qu'elle s'hybride avec lui et que donc elle est "orientée" 3'5' (mm si elle synthétise de 5' vers 3').

Or pour un adn double brin circulaire du coup il n'y a pas d'orientation ? fin aucun n'est ni 5'3' ni 3'5' si ? dans ce cas l'amorce 3 par ex (pièce jointe) ne peut pas être "fausse" (contrairement à un brin linéaire ou on peut nous proposer des amorces qui sont dans le même sens que le brin donc ça marche pas comme les exos PCR du S1) et, c'est juste que selon si on prend la 3 ou la 4 l'amorce synthétise vers un sens ou l'autre ?

Dans ce cas est-ce qu'on doit considère que si l'amorce est au dessus du double brin (ex amorce 3), elle s'hybride forcément avec le brin le plus extérieur ? parce que sinon on ne peut pas savoir du coup si elle va s'hybrider avec celui extérieur ou intérieur et donc si elle va synthétiser un fragment correspondant au brin ext ou int ?

de même j'ai employé extérieur ou intérieur car je ne sais pas lequel correspondant au brin sens/ non sens, est-ce qu'on peut le déterminer ici ?

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Salut !

Je pense avoir compris ton interrogation et je crois qu'il n'y a pas vraiment de réponse parce qu'il n'est pas demandé de connaître les brins sens, les brins non sens et l'orientation 5' 3' de chacun des brins. => Ça c'était pour le premier semestre

 

2e Semestre : C'est vraiment une histoire de légo -> on coupe des parties de plasmides pour former un plasmide recombinant à injecter dans des cellules.

Pour les plasmides circulaires double brins, on va pas chercher à étudier de réplication avec l'hybridation d'amorces etc mais juste la transcription de certains gènes.

Le sens de lecture des gènes est représenté par les flèches sur le plasmide donc il faut que le clonage soit bien orienté. Mais la encore pas besoin de savoir quel brin est lu et quel brin est recopié.

 

Je sais pas si j'ai répondu clairement si tu veux que je réexplique autrement dis moi !

(PS j'ai pas réussi a trouver la diapo dont tu parles)

Edited January 18 by mathi.asparagine

[Celia_que]

  On 1/18/2025 at 1:51 PM, mathi.asparagine said:

Salut !

Je pense avoir compris ton interrogation et je crois qu'il n'y a pas vraiment de réponse parce qu'il n'est pas demandé de connaître les brins sens, les brins non sens et l'orientation 5' 3' de chacun des brins. => Ça c'était pour le premier semestre

 

2e Semestre : C'est vraiment une histoire de légo -> on coupe des parties de plasmides pour former un plasmide recombinant à injecter dans des cellules.

Pour les plasmides circulaires double brins, on va pas chercher à étudier de réplication avec l'hybridation d'amorces etc mais juste la transcription de certains gènes.

Le sens de lecture des gènes est représenté par les flèches sur le plasmide donc il faut que le clonage soit bien orienté. Mais la encore pas besoin de savoir quel brin est lu et quel brin est recopié.

 

Je sais pas si j'ai répondu clairement si tu veux que je réexplique autrement dis moi !

(PS j'ai pas réussi a trouver la diapo dont tu parles)

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Okayy oui je vois merci beaucoup !