ADN pol ?

[Rc08]

 Salut à tous, j’espère que vous allez bien

 

Je me rends compte que je me mélange un peu les pinceaux entre tous les ADN polymérase,

Est-ce qu’il y aurait un super tuteur génome qui pourrait m’expliquer un petit peu les différences entre les ADN polymérase, I, III, bêta, gamma, delta, alpha…tout ça tout ça quoi 

 

PS (désolée pour la modif) : Est-ce que déjà c’est juste si je dis que les ADN polymérases un et trois se trouvent partout et que les ADN polymérase Gama delta et bêta se trouvent uniquement chez les eucaryotes?

 

J’espère que ma requête est pas trop trop longue

 

Merciii 

Edited December 8, 2024 by Rc08
Histoire d’avoir une petite précision en plus

[Jojoba]

Pas de souci pour la précision, c’est une question importante pour bien comprendre!

 

Je commence par les ADN polymérases I et III :

 

Ces polymérases sont spécifiques aux procaryotes,

D’abord tu as l’ADN polymérase I :

Son rôle principal c’est la réparation de l’ADN et élimination des amorces d’ARN.

Elle possède une activité exonucléase 5’→3’, qui permet de retirer les amorces d’ARN, et une activité exonucléase 3’→5’ pour la relecture (correction d’erreurs).

Ensuite l’ADN polymérase III :

C’est l’enzyme principale de la réplication de l’ADN chez les procaryotes.

Elle à aussi une activité exonucléase 3’→5’ pour la relecture.

 

Puis tu as les ADN polymérases des eucaryotes, en effet chez les eucaryotes, il existe plusieurs types d’ADN polymérases avec des fonctions spécialisées :

 

Tu as l’ADN polymérase alpha (α)

Son rôle principal c’est de démarrer la réplication.

Elle travaille en association avec une primase (synthèse des amorces d’ARN).

 

Tu as aussi l’ADN polymérase delta (δ)

Son rôle principal c’est la réplication de l’ADN sur le brin retardé.

Elle possède une activité de correction d’erreurs (exonucléase 3’→5’).

 

Il y a également l’ADN polymérase epsilon (ε)

Son rôle principal c’est la réplication du brin avancé.

En fait c’est similaire à la polymérase delta, mais spécialisée pour un brin spécifique.

 

Et enfin l’ADN polymérase bêta (β)

Son rôle principal c’est la réparation de l’ADN (réparation des bases excisées).

Elle n’est pas impliquée dans la réplication par contre !

 

Petite conclusion en gros :

Les polymérases I et III sont exclusivement procaryotes.

Les polymérases α, β, δ, ε se trouvent exclusivement chez les eucaryotes et sont impliquées dans la réplication ou la réparation de l’ADN nucléaire.

 

J’espère avoir répondu à ta question n’hésite pas si tu as besoin de plus de précisions :) !

Edited December 8, 2024 by Jojoba

[jlr.10]

Salut @Rc08, 

 

les ADN polymérase sont des enzymes qui vont permettre la synthèse de l’ADN lors de la réplications (de manière complémentaire et anti-aparallèle au brin d’ADN matrice). Ce sont des ADN polymérase ADN dépendante (c’est à dire qu’elles ont besoin d’une matrice ADN) qui ont besoin d’une amorces ARN pour commencer à synthétisé l’ADN. 

 

Chez les procaryotes tu retrouve :

 

• l’ADN polymérase III :
  • Activité polymérase 5’->3’ = sont activité de synthèse de l’ADN dans le sens 5’->3’ (mais elle lit le brin matrice dans le sens 3’ -> 5’, pour qu’elle puisse synthétisé de manière complémentaire et anti-parallèle) 
  • activité exonucléase 3’->5’ = sont activité de correction des erreur (proof-reading)en enlevant les mauvais nucléotide (= l’erreur qu’elle a fait en synthétisant) dans le sens 3’->5’. 
  • C’est enzyme processive = elle reste accrocher à la matrice ADN lorsqu’elle synthétise. 
  • L’ADN polymérase III synthétise le brin continu ET le brin discontinue 

 

• L’ADN polymérase I :
  • Activité polymérase 5’->3’ = sont activité de synthèse de l’ADN dans le sense 5’ vers 3’ (mais elle lit le brin matrice dans le sens 3’ -> 5’, pour qu’elle puisse synthétisé de manière complémentaire et anti-parallèle). C’est par cette activité que l’ADN polymérase I permet de remplacer les amorces ARN par de l’ADN. 
  • Activité exonucléase 3’->5’ = sont activité de correction des erreurs (proof-reading) en enlevant les mauvais nucléotide (= l’erreur qu’elle a fait en synthétisant) dans le sens 3’->5’.
  • C’est une enzyme processive = elle reste accrocher à la matrice ADN lorsqu’elle synthétise l’ADN.  

  • Activité exonucléase 5’ -> 3’ = elle est capable d’enlever les nucléotides dans le sens 5’->3’ et donc elle peut enlever les amorces ARN en fin de réplication.

  • c’est un ADN polymérase translesionnelle = remplace les amorces ARN par de l’ADN. 

 

• L’ADN polymérase III et I ne sont retrouver QUE chez les procaryotes

 

Chez les eucaryotes :

 

• ADN polymérase alpha :
  • permet la synthèse des amorces d’ARN en début de réplication. /!\ c’est une ARN polymérase 

 

• ADN polymérase epsilon :
  • activité polymérase 5’->3’ = synthétise l’ADN dans le sens 5’->3’ (mais elle lit le brin matrice dans le sens 3’-> 5’ pour permettre une synthèse anti-parallèle du nouveau brin d’ADN)
  • activité exonucléase 3’->5’ = sont activité de correction des erreur (proof-reading) en enlevant les mauvais nucléotide (= l’erreur qu’elle a fait en synthétisant) dans le sens 3’->5’. 
  • ADN polymérase epsilon ne synthétise QUE le brin leader (ou brin continue) 
  • C’est une enzyme processive = elle reste accrocher à la matrice ADN lorsqu’elle synthétise l’ADN. 

 

• ADN polymérase delta :
  • activité polymérase 5’->3’ = synthétise l’ADN dans le sens 5’->3’ (mais elle lit le brin matrice dans le sens 3’-> 5’ pour permettre une synthèse anti-parallèle du nouveau brin d’ADN)
  • activité exonucléase 3’->5’ = sont activité de correction des erreur (proof-reading) en enlevant les mauvais nucléotide (= l’erreur qu’elle a fait en synthétisant) dans le sens 3’->5’. 
  • ADN polymérase Delta ne synthétise QUE le brin discontinu (ou brin retardataire). Elle synthétise donc les fragments d’Okasakie Petit tips de mémorisation : Delta = Discontinue. 
  • C’est une enzyme processive = elle reste accrocher à la matrice ADN lorsqu’elle synthétise l’ADN. 

 

• ADN polymérase beta :
  • Activité polymérase 5’->3’ = sont activité de synthèse de l’ADN dans le sense 5’ vers 3’ (mais elle lit le brin matrice dans le sens 3’ -> 5’, pour qu’elle puisse synthétisé de manière complémentaire et anti-parallèle). C’est par cette activité que l’ADN polymérase beta permet de remplacer les amorces ARN par de l’ADN. 
  • Activité exonucléase 3’->5’ = sont activité de correction des erreur (proof-reading) en enlevant les mauvais nucléotide (= l’erreur qu’elle a fait en synthétisant) dans le sens 3’->5’. 
  • C’est une enzyme processive = elle reste accrocher à la matrice ADN lorsqu’elle synthétise l’ADN.  

  • Activité exonucléase 5’ -> 3’ = elle est capable d’enlever les nucléotides dans le sens 5’->3’ et donc elle peut enlever les amorces ARN en fin de réplication.

  • c’est un ADN polymérase translesionnelle = remplace les amorces ARN par de l’ADN. 

 

• Les ADN polymérase alpha, epsilon, beta et delta ne sont retrouvées que chez les Eucaryotes. 

 

J’espère que c’est un peu plus claire, n’hésite pas si tu as d’autres questions. 

 

Bonn courage ! 

 

[Rc08]

Omg merci beaucoup vous êtes les meilleures, c’est super clair et ça me sauve 

 

Mais du coup, j’ai juste 3 petites questions qu’il me reste :

 

1/ Qui est-ce qui synthétise les amorce chez les procaryotes étant donné qu’il n’y a pas de polymérase alpha ? 

2/ du coup, si j’ai bien compris, vous me dites que la polymérase bêta va réparer les bases excisées par les exonucleases, et n’est pas vraiment impliquée dans la réplication MAIS qu’elle va quand même pouvoir supprimer les amorces chez les eucaryotes ? 

3/ J’ai vu certains QCM où il était indiqué dans la correction que l’ADN polymérase I n’avait pas besoin d’amorce pour synthétiser, et je ne suis pas sûre d’avoir super bien compris cette notion… je pense que j’ai mal compris la correction et j’ai tout déformé

 

Merciii

[jlr.10]

Pour répondre à tes questions :

 

1) Chez les procaryotes c’est la primase qui synthétise les amorces ARN, c’est aussi une ARN polymérase. 

 

2) J’avoue que cette partie est un peu ambiguë. Dans le cour de Mme.Couderc il est préciser que c’est la RNase H qui excise les amorces ARN chez les eucaryotes, et que c’est l’ADN polymérase béta qui re synthétise de l’ADN à la place des amorces ARN. Mais il faut quand même retenir que l’ADN polymérase béta a une activité exonucléase 5’->3’. (Je pense que c’est la manière dont tu doit le retenir après n’hésite pas à demander a Mme.Couderc pour plus de précision).

 

3) Effectivement l’ADN polymérase I n’a pas besoin d’amorce ARN pour synthétyser  l’ADN, puisqu’elle synthétise l’ADN (qui remplace les amorces ARN) à partir de l’extrémité 3’ OH des fragments d’Okasaki (qui sont les fragments d’ADN au préalable synthétisé lors de la réplication). 

 

J’espère que cela répond à tes questions. 

 

Bon courage ! 

 

[Rc08]

Super j'ai compris !

Merci beaucoup !