Poly de l'avent qcm 11 sujet type 2

[MileyVirus]

Bonjouuuur, je ne comprend rien à ce qcm, surtout la question A, pourquoi le milieu de culture est radioactif ? Ensuite pourquoi le cytoplasme n'est pas marqué ?est-ce qu'on peut m'expliquer le lien avec la translocation co traductionnelle ?

Merci beaucouup

Edited November 24, 2024 by SarahSadia

[PetiteComète]

Coucou alors je te fais un long message pour que tout soit clair : 

 

 

On veut étudier le lieu de présence de la protéine HappyBiocell dans des cellules de cerveau => des neurones

On a placé ces cellules dans des boites de pétris en présence d'un milieu de culture riche en AA radioactif. Or tu sais que la cellule a besoin de AA pour fonctionner et que les acides aminés sont les éléments principaux des protéines, à la base de celles-ci (qui sont un enchainement d'acides aminés) 

Ainsi les cellules vont "attraper" ces AA et les faire entrer dans leur cytoplasme selon leur besoins. 

Ces AA vont aller aux différents endroits nécessaires à la synthèse de protéines, ici de la protéine HappyBiocell. 

Nous pouvons voir où se trouve ces AA car ils sont radioactifs et donc observables. 

 

Retour à l'expérience : 

Les chercheurs déposent des cellules dans ce milieu en présence de AA* pendant différents temps.

On met les cellules en présence de AA* pendant 3min: les cellules peuvent prendre ces AA comme si ils venaient de la MEC (matrice extra cellulaire). Ensuite on lave les cellules : il n'y a plus de AA dans le milieu et on regarde où est la radioactivité => ceci est renseigné dans le tableau, radioactivité repéré dans le RE. Ce qui veut dire que la AA* est dans le RE. 

En parallèle donc, d'autre cellules ont été mises en présence du AA* mais cette fois on les laisse 6 min, puis on les lave et on les étudie. 

Tu vois donc que en 6 min, le AA* ne se trouve plus dans le RE mais dans l'Appareil de Golgi.

Tu fais de même pendant 66min et 666min. 

 

Pour etre plus claire : au moment où tu laves tes cellules, tu les figes, de sorte que tu peux te dire que une fois qu'elles ne sont  plus dans le milieu riche en AA, le trafic intracellulaire ne bouge plus : les AA* sont bloqués là où ils se trouvaient.

 

Sachant que les protéines sont constitués de AA, tu peux en déduire que les AA* ont été utilisés pour constituer des protéines, ainsi le compartiment où tu retrouves les AA* est en fait le compartiment où se trouve une protéine* synthétisée par le neurone : la protéine HappyBiocell.

 

Maintenant le QCM : 

ITEM A : On peut supposer que le milieu est radioactif car tu sais que tu as placé des AA* dans ce milieu justement. On voit que la radioactivité ne se trouve plus dans les différents compartiments cellules étudiés, or c'est le trajet de ta protéine que tu regardais. Donc ta protéine a été synthétisée dans le RE, elle a maturé dans le AG et ensuite elle a été sécrétée. A partir de là, tu peux faire 2 hypothèses : 

* la protéine à ete envoyé à un autre compartiment cellules non étudié (mitochondrie, membrane plasmique...) 

* la protéine à ete envoyée dans le milieu extracellulaire pour etre secrétée : on ne sait pas quelle est le role de cette protéine mais on te dit quelle est retrouvé au niveau de neurones, or tu sais que les neurones ont tendance à sécréter des neurotransmetteurs (souvent constitués de AA) dans la fente synaptique : on ne sait pas si c'est le cas de HappyBiocell mais c'est une hypothèse.

Les deux hypothèses sont possibles, donc l'item A est vrai. 

 

ITEM B : 

La protéine qui est radioactive (car constituée de AA eux même radioactifs) etait dans le RE au bout de 3min : lieu de synthèse des protéines; puis au temps 6 tu retrouves la protéine* dans l'appareil de Golgi (lieu de maturation des protéines). Tu sais d'après ton cours que ceux sont les vésicules de type COPII qui permettent le passage du Re vers le Golgi (COPI fait le transport du Golgi vers le RE)

 

ITEM C : 

Non pas forcement :la traduction des protéines est certes initiée dans le cytosol mais elle ne s'y termine pas forcement : elle peut aussi se faire dans le RE (via mécanisme de translocation co-traductionnel). Si c'est cela la protéines n'est présente que quelques instant dans le cytosol, il est possible que l'on est pas extrait les cellules pile au bon moment : donc c'est possible qu'il ny ai pas d'anomalie (c'est meme probable)

 

-------

 

Retour aux explications : 

De la colchicine est ajoutée au milieu de culture au temps 42 : donc les cellules récupérés au temps 3 et 6 ne sont pas impactées .

La colchicine est un agent dégradant les microtubules, or tu sais que l'Appareil de Golgi est associés aux microtubules. Donc tu en déduit que l'ajout de colchicine entrain un démantèlement de l'AG sous formes de mini vésicules de Golgi.

 

ITEM D : 

Donc oui (cf au dessus)

 

ITEM E : 

Oui aussi car au temps 42min on ne peut savoir si la protéine* est encore dans l'appareil de Golgi ou si elle se trouve dans des vésicules de sécrétion. Ainsi on suppose qu'il y a un peu des deux : un peu de radioactivité dans le Golgi et un peu dans les vésicules de sécrétion. Le Golgi n'était plus stable, les protéines qui s'y trouvaient sont localisés dans des petites vésicules golgiennes

 

 

Voila, c'était un peu long désolée, j'espère que c'est clair 

Edited November 24, 2024 by PetiteComète

[MileyVirus]

  On 11/24/2024 at 7:30 AM, PetiteComète said:

Coucou alors je te fais un long message pour que tout soit clair : 

 

 

On veut étudier le lieu de présence de la protéine HappyBiocell dans des cellules de cerveau => des neurones

On a placé ces cellules dans des boites de pétris en présence d'un milieu de culture riche en AA radioactif. Or tu sais que la cellule a besoin de AA pour fonctionner et que les acides aminés sont les éléments principaux des protéines, à la base de celles-ci (qui sont un enchainement d'acides aminés) 

Ainsi les cellules vont "attraper" ces AA et les faire entrer dans leur cytoplasme selon leur besoins. 

Ces AA vont aller aux différents endroits nécessaires à la synthèse de protéines, ici de la protéine HappyBiocell. 

Nous pouvons voir où se trouve ces AA car ils sont radioactifs et donc observables. 

 

Retour à l'expérience : 

Les chercheurs déposent des cellules dans ce milieu en présence de AA* pendant différents temps.

On met les cellules en présence de AA* pendant 3min: les cellules peuvent prendre ces AA comme si ils venaient de la MEC (matrice extra cellulaire). Ensuite on lave les cellules : il n'y a plus de AA dans le milieu et on regarde où est la radioactivité => ceci est renseigné dans le tableau, radioactivité repéré dans le RE. Ce qui veut dire que la AA* est dans le RE. 

En parallèle donc, d'autre cellules ont été mises en présence du AA* mais cette fois on les laisse 6 min, puis on les lave et on les étudie. 

Tu vois donc que en 6 min, le AA* ne se trouve plus dans le RE mais dans l'Appareil de Golgi.

Tu fais de même pendant 66min et 666min. 

 

Pour etre plus claire : au moment où tu laves tes cellules, tu les figes, de sorte que tu peux te dire que une fois qu'elles ne sont  plus dans le milieu riche en AA, le trafic intracellulaire ne bouge plus : les AA* sont bloqués là où ils se trouvaient.

 

Sachant que les protéines sont constitués de AA, tu peux en déduire que les AA* ont été utilisés pour constituer des protéines, ainsi le compartiment où tu retrouves les AA* est en fait le compartiment où se trouve une protéine* synthétisée par le neurone : la protéine HappyBiocell.

 

Maintenant le QCM : 

ITEM A : On peut supposer que le milieu est radioactif car tu sais que tu as placé des AA* dans ce milieu justement. On voit que la radioactivité ne se trouve plus dans les différents compartiments cellules étudiés, or c'est le trajet de ta protéine que tu regardais. Donc ta protéine a été synthétisée dans le RE, elle a maturé dans le AG et ensuite elle a été sécrétée. A partir de là, tu peux faire 2 hypothèses : 

* la protéine à ete envoyé à un autre compartiment cellules non étudié (mitochondrie, membrane plasmique...) 

* la protéine à ete envoyée dans le milieu extracellulaire pour etre secrétée : on ne sait pas quelle est le role de cette protéine mais on te dit quelle est retrouvé au niveau de neurones, or tu sais que les neurones ont tendance à sécréter des neurotransmetteurs (souvent constitués de AA) dans la fente synaptique : on ne sait pas si c'est le cas de HappyBiocell mais c'est une hypothèse.

Les deux hypothèses sont possibles, donc l'item A est vrai. 

 

ITEM B : 

La protéine qui est radioactive (car constituée de AA eux même radioactifs) etait dans le RE au bout de 3min : lieu de synthèse des protéines; puis au temps 6 tu retrouves la protéine* dans l'appareil de Golgi (lieu de maturation des protéines). Tu sais d'après ton cours que ceux sont les vésicules de type COPII qui permettent le passage du Re vers le Golgi (COPI fait le transport du Golgi vers le RE)

 

ITEM C : 

Non pas forcement :la traduction des protéines est certes initiée dans le cytosol mais elle ne s'y termine pas forcement : elle peut aussi se faire dans le RE (via mécanisme de translocation co-traductionnel). Si c'est cela la protéines n'est présente que quelques instant dans le cytosol, il est possible que l'on est pas extrait les cellules pile au bon moment : donc c'est possible qu'il ny ai pas d'anomalie (c'est meme probable)

 

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Retour aux explications : 

De la colchicine est ajoutée au milieu de culture au temps 42 : donc les cellules récupérés au temps 3 et 6 ne sont pas impactées .

La colchicine est un agent dégradant les microtubules, or tu sais que l'Appareil de Golgi est associés aux microtubules. Donc tu en déduit que l'ajout de colchicine entrain un démantèlement de l'AG sous formes de mini vésicules de Golgi.

 

ITEM D : 

Donc oui (cf au dessus)

 

ITEM E : 

Oui aussi car au temps 42min on ne peut savoir si la protéine* est encore dans l'appareil de Golgi ou si elle se trouve dans des vésicules de sécrétion. Ainsi on suppose qu'il y a un peu des deux : un peu de radioactivité dans le Golgi et un peu dans les vésicules de sécrétion. Le Golgi n'était plus stable, les protéines qui s'y trouvaient sont localisés dans des petites vésicules golgiennes

 

 

Voila, c'était un peu long désolée, j'espère que c'est clair 

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Coucou !!Merci beaucoup pour la patiente et la bienveillance que tu a mis dans ta réponse, tout est très clair et super bien expliqué/détaillé!! Merci encore pour l'aide ! Trés bonne journée à toi et courage dans tes études