amorces pour PCR

[enimsay]

https://tutoweb.org/public/uploads/librairie/Innovations Pédagogiques/PASS/Semestre 1/UE 1 - GENOME/S1 - Fiche Astuce - PASS - Genome (Déterminer les amorces).pdf

 

Bonsoiir, je crois ne pas avoir tres bien compris ce que Pr Coudert considère comme 1ere amorce et 2nd amorce, et laquelle correspond à quel brin, sens ou anti sens, sur la fiche astuce il est marqué au tout début que l’amorce 1 est complémentaire du brin anti sens, et l’amorce 2 du brin sens, mais dans l’exemple donné plus bas ça m’a l’air d’être l’inverse, ou alors j’ai dû mal comprendre? 

 

Merci d’avance !

[p'tite_crevette]

Bonsoir ! C'est bien la première amorce qui est complémentaire du brin anti-sens (et donc elle ressemble à une partie du brin sens), tandis que la deuxième amorce est complémentaire du brin sens. D'après l'exemple, c'est bien cela. Il est cependant important de distinguer la complémentarité de la "ressemblance" : chaque amorce a une séquence de nucléotides similaire à celle du brin sens, elle est donc complémentaire du brin anti-sens.

 

J'espère avoir été claire et sinon n'hésite pas à me poser d'autres questions !

[p'tite_crevette]

Petit exemple repris sur le sujet :

 

5' CGATGTTCTACGTACGCACG ... // ... CATACCATGAATGCTGTAG 3' Brin sens

                                                                                 <--- Amorce 2

 

3' GCTACAAGATGCATGCGTGC ... // ... GTATGGTACTTACGACATC 5' Brin anti-sens

Amorce 1 --->

 

Donc

amorce 1 = 5' CGATGTTCT 3'

 

amorce 2 = 3' TACGACATC 5' --> 5' CTACAGCAT 3'

 

Comme tu peux le voir ici l'amorce 1 est complémentaire du brin anti-sens mais est similaire à une partie du brin sens. Même chose pour l'amorce 2 : elle est complémentaire du brin sens mais est similaire à une partie du brin anti-sens.

Edited November 9, 2024 by p'tite_crevette

[enimsay]

Ahhhh oui je vois mieux, merciii