Classement des séquences en 3 grands groupes

[Morpheus531]

Bonjour !

 

Malgré de nombreuses lectures des diapos je ne comprends pas très bien le classement des séquences en 3 grands groupes 

 

- ADN -> ARN codant pour des séquences “uniques”

- Gènes répétés (ceux qui codent pour des histones, les autres pour des transposons)

- séquences hautement répétées non codantes 

 

Je ne comprends vraiment pas ces notions, pareil que "gène solitaire", "tandem", le schéma des transposons/rétroposons (je ne comprends pas la différence entre les 2) 

 

Quelqu'un pourrait m'aider SVP?

A l'aide 

 

Merci infiniment 

[Jojoba]

Bonjour ! Je vais essayer de t'éclairer sur ça.

Tout d'abord concernant les trois groupes que tu as évoqué :

 

-ADN -> ARN codant pour des séquences “uniques” : Ici cela fait référence aux gènes qui produisent des protéines spécifiques. Ces séquences sont généralement uniques dans le génome et codent pour des fonctions particulières.

- Ensuite tu as les gènes répétés : Ces gènes sont des séquences qui se répètent plusieurs fois dans le génome. Par exemple, les gènes codant pour des histones comme tu l'as évoqué, qui sont des protéines essentielles pour la structure de la chromatine, et d'autres qui codent pour des éléments mobiles comme les transposons.

- Puis les séquences hautement répétées non codantes : Ce sont des séquences qui se répètent encore plus souvent, mais qui ne codent pas pour des protéines. Elles peuvent jouer des rôles dans la régulation de l'expression des gènes ou dans la structure du chromosome.

Pour les termes "gène solitaire" et "tandem", un gène solitaire c'est simplement un gène unique qui n'a pas de copies supplémentaires dans le génome, tandis qu'un gène en tandem c'est un gène qui a plusieurs copies adjacentes dans le génome.

Et enfin concernant les transposons et rétroposons, la principale différence réside dans leur mécanisme de déplacement. Les transposons se déplacent directement d'un endroit à un autre dans l'ADN, tandis que les rétroposons utilisent un intermédiaire ARN pour se répliquer et s'insérer à un nouvel emplacement dans le génome.

 

Voilà en résumé ! J'espère avoir répondu à ta question n'hésite pas si tu as besoin de plus d'explication :)

[jlr.10]

Bonjour @Morpheus531, 

 

C’est vrai qu’avec toutes ces notions on s’y perd vite. 

 

• Premièrement un gène est une séquence d’ADN qui code TOUJOUR un ARN, c’est la définition même du gène : « chaque région de l’ADN qui peut produire une molécule d’ARN fonctionnelle est un gène. (cf. Diapo 70 cour 1-3 Mme Couderc) ou encor : « un gène est une séquence transcrite en un ARN (diapo 72 du même cour). 
  • Un ARN fonctionnelle est un ARN qui a une fonction précise dans la cellules : Les ARNm donne les protéines ; ARNr forme (en partie) les ribosomes ; les ARNt transportent les acide aminé vers les ribosomes, etc… Tous c’est ARN sont produit à partir de gènes. 
  • C’est pour cela qu’on appel les séquences d’ADN codante : des gènes.
  • les gènes codent pour quelque chose :
    • les caractères (couleurs des cheveux, taille, couleur de la peau, etc..)
    • Responsable de pathologies (dans ce cas là c’est plutôt un problème du gène qui entraine la maladie) 

 

• Les séquences d’ADN non codante son appelé junk DNA
  • se sont les région « non transcrite » c’est à dire qui ne code pas pour des ARN (cf. Diapo 76 en bleu clair sur le diagramme) 

 

• les gènes solitaire :
  • sont des gènes à copie unique qu’on retrouve sur chaque génome haploïde
  • notre génome est diploïde dans toutes nos cellules (sauf les gamètes)  = il est en deux exemplaires car on a des paires de chromosome et dans ces paires on a deux chromosomes identique au niveau de la composition en gènes (mais qui ne portent pas forcément les mêmes allèles).
  • Le génome haploïde qu’on retrouve dans les gamète, c’est un seul exemplaire de notre génome = un seul chromosome par « paire » (mais ce ne sont plus des paires puisqu’on a un chromosome 1, un chromosome 21, un chromosome 19 etc.. par exemple 
  • ce sont des gènes donc des séquences d’ADN codant pour des ARN.

 

• Les gènes moyennement répétés :
  • c’est des gènes qui vont être répéter en tandem = à la suite les unes des autres. 
  • C’est le cas des gènes qui code pour des ARNr, des ARNt ou des histones 
  • en gros dans ton génome tu va avoir le gène qui code pour un ARNt (par exemple) qui sera répété plusieurs fois, donc tu aura plusieurs copies de ce gène, et ces copie vont se disposé les unes après les autres
  • l’utilité de ces séquences est de pouvoir répliquer rapidement (comme les copie du gènes sont les unes après les autres) une quantité importante de ARNt (par exemple) au moment où ont en a beaucoup besoin.

 

• ADN répétés dispersé :
  • Ce sont les transposons et les rétrotransposon. On les appels ainsi car se sont des séquences d’ADN à la capacité de mobilité dans le génome.
  • la différence entre les deux est :
    • les transposons sont des séquences d’ADN qui vont « sortir » du génome et allée directement s’insérer autre part dans le génome (c’est pour ça que sur le schéma de la diapo 84, tu vois la séquence orange = le transposons, qui va se mettre directement dans la séquence ADN cible en bleu) 
    • Pour les rétrotransposon : sur le schéma, tu vois que la séquence en noir = le rétrotransposon va d’abord être transcript en ARN (séquence rouge) puis réverse transcript en ADN séquence noire (= pour refaire le rétrotransposon) puis ensuite cette séquence d’ADN va s’insérer dans la séquence d’ADN cible en bleu. (Je ne saurais pas t’expliquer pourquoi ça doit passer par un ARN pour redevenir de l’ADN )
  • Ces deux type d’ADN vont être capable de s’insérer n’importe où dans le génome. Le risque est qu’il s’insère dans la séquence d’un gène ce qui va inactivé ce gène.( en fonction du gène qui est touché ça sera plus ou moins grave)

 

• Séquences d’ADN hautement répétés :
  • C’est des séquences d’ADN qui vont être répété un certain nombre de fois, qui ne code pour rien du tout et qui n’ont pas de capacité de mobilité dans le génome.
  • en fonction de la longueur de ces séquence hautement répétés et de leur localisation dans le génome on parlera de : 
    • microsatellite : séquences courtes ( 2 à 8 pdb) qui vont être répéter 100 000 fois et qui seront donc des points chaud de mutation. On les retrouves dans plein d’endroit dans le génome et notamment au niveau des télomères.
      • exemple de microsatelitte :
        • la séquence de 2 pdb : GC (diapo 85)
        • la séquence de 6 pdb : TTAGGG (séquence télomérique)
    • Minisatellites: séquence d’ADN plus longue répétées en tandem (c’est à dire à la suite) qui seront plus des point de recombinaison.
    • satellite : séquence d’ADN qui sont encore plus longue, elles se situe proche du centromère et ont plutôt un rôle structurale pour la molécule d’ADN.
  • l’utilité de ces séquences d’ADN hautement répété et non codante, est de protéger les séquences d’ADN codantes (donc les gènes) contre les mutations. En effet une mutation tapant au hasard dans le génome aura plus de chance d’impacter une séquence non codante (qui sont hautement répété) que une séquence codante. Ainsi l’impact de la mutation sera « moins grave ». 

Voilà, j’espère que cela t’a aider, n’hésite pas si tu as d’autre questions. 

 

Bon courage !