QCM génome

[noidonthaveagun]

Hey ! 

Je viens de faire ce QCM et je ne comprends rien de rien ni aux questions ni à la correction (VFVVV) 

Quelqu'un pourrait m'aider ??

 

[Bastitine]

Salut @noidonthaveagun ! C'est vrai que la mise en page rend la compréhension plus complexe haha

 

Tu as le double brin suivant :

                                                                                       5' AAAAAAAAAAAAAAAAAA-------------GGGGGGGGGGGGGGGGGGGG 3' (18 A et 20 G avec un trou au milieu)

                                                                                       3' TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC 5' (29 C et 25 T, en espérant que j'aie bien compté)

 

Donc il te manque 7 A (il faut qu'il y ait autant de A que de T, 25 T contre seulement 18 A, donc 25-18=7) et 9 G (29 - 20 = 9). Ces derniers vont être incorporés par la polymérase qui va pouvoir combler le trou puis grâce à la ligase finaliser la réparation. Calculs absolument pas nécessaires quand tu fais les qcms, il faut juste te rendre compte qu'il manque à la fois des A et des G. Je fais ces calculs juste pour que ça soit le plus clair possible pour toi.

 

Pour l'item A, c'est VRAI tu auras toujours autant de cytosine donc toujours la mm quantité de tritium (3H) car seule la cytosine est préalablement marquée au tritium.

Pour l'item B, c'est FAUX il est de toute façon impossible d'avoir une radioactivité de 32P ici car le 32P est le phosphate gamma (c'est à dire le 3e en partant du carbone 5' du sucre, il sera donc éliminé sous forme de pyrophosphate avant de rentrer dans l'ADN). De plus, c'est sur le phosphate gamma des dTTP et on a dit qu'on allait incorporer des adénines et des guanines (par le biais de dATP et dGTP bien sûr on incorpore pas juste des bases azotées mais des nucléotides) dans le brin du haut !

Pour l'item C, c'est VRAI car comme dit précédemment on incorpore de la guanine dans le dGTP donc aura bien la radioactivité du carbone 14 présente.

Item D, on en a déjà parlé c'est bien VRAI.

Item E, bien VRAI en combinant l'action de la polymérase qui prend pour matrice le brin complémentaire (celui du bas) et de la ligase tu retrouves bien un double brin normal et continu (sans cassure).

 

Voilà hésite pas à me dire si je t'ai perdu qqpart ^^

Bon courage !

 

[jlr.10]

Salut @noidonthaveagun

 

Je complète la réponse de @Bastitine, en ce qui concerne l’énoncer 

/!\ Une des première chose à comprendre est que là on se trouve « in-vitro » (dans un tube à essais) pas dans une cellule (en gros on a récupérer de l’ADN et on l’a mit dans un tube à essais ) 

• Tout d’abord on nous dit qu’on marque l’ADN au 3H sur la cytosine :
  • le 3H est l’hydrogène radioactif (aussi appeler tritium ) cela permettra de « repérer » les cytosine qui seront ajouter dans ta molécule d’ADN

 

• ensuite on te dit qu’il y a une coupure et qu’on utilise une ADN polymérase 1 :
  • comme il y a une coupure elle sera réparée par l’activité de synthèse d’ADN de l’ADN polymérase 1 et bien sûr tous les cofacteurs nécéssaire à la synthèse d’ADN.

 

• Ensuite on prend les désoxyribonucléotides permettant la synthèse d’ADN : dATP, dGTP, dCTP, dTTP (il faut absolument les connaître !), deux d’entre eux vont être marquer encore une fois par un élément radioactif :
  • les dGTP qui seront ajouter dans la molécule d’ADN seront marqués au carbone 14 (14C) qui est le carbone radioactif : donc le dGTP qu’on ajoute il porteront un 14C 
  • les dTTP qui seront ajoutés à la molécule d’ADN seront marqués au phosphate 32 (32P).  Et là attention on te précise bien que c’est le phosphate gamma qui est marquée. Donc si tu te souviens bien, lors de leur « arrivée » les désoxyribonucléotides porte 3 groupements phosphates  Et lorsqu’il sont intégrés dans l’ADN ils vont « perdre » un phosphate qui sera toujours le phosphate gamma (seul le 1er désoxyribonucléotide de ta molécule d’ADN gardera son phosphate gamma ) donc à la fin de la synthèse d’ADN, tu ne devrais pas retrouver de 32P sur ta molécule d’ADN ( c’est pour ça que la B est fausse). 

 

Voilà j’espère que ça t’aura aider ! 

 

 

Edited October 2, 2024 by jlr.10

[noidonthaveagun]

 

@POMME Mais justement, tous ces dXTP on ne les a pas vu en cours, arriveront ils prochainement où nous étions sensés rechercher de quoi il s'agissait lorsque Mme Couderc les a abordés dans le contexte de la PCR ?

[Bastitine]

53 minutes ago, noidonthaveagun said:

 

@POMME Mais justement, tous ces dXTP on ne les a pas vu en cours, arriveront ils prochainement où nous étions sensés rechercher de quoi il s'agissait lorsque Mme Couderc les a abordés dans le contexte de la PCR ?

Salut les dXTP c'est juste les nucléotides substrats de la synthèse d'ADN, c'est pour ça qu'on en a besoin pour la PCR qui est une amplification d'ADN !

"X" c'est une notation générique pour tous les désigner mais en réalité c'est X = A, T, G ou C.

Donc ces dXTP (désoxynucléosides triphosphates, c'est ça ce que ça veut dire) ce sont le dATP, dTTP, dGTP et dCTP. Et oui du coup vous êtes sensés savoir et surtout comprendre que dXTP correspond à ça.

 

Par exemple si un item te dit qu'on a besoin de XTP lors de la PCR (donc de nucléosides triphosphates -> pas désoxy) c'est faux parce qu'on synthétise de l'ADN et pas de l'ARN lors de la PCR donc on a besoin de dXTP.

 

C'est plus clair ?

[noidonthaveagun]

@POMME Ok ok c'est plus clair merci !